La preparación de muestras se divide en dos grupos. Preparación en fresco y preparación en seco.
La preparación en fresco o húmedo es la aconsejable para observar tejidos biológicos o microorganismos que necesitan ser hidratados para no perder sus propiedades.
Este tipo de preparación en húmedo mantiene la hidratación de la muestra durante 30 minutos aproximadamente.
La preparación en seco se utiliza para muestras que no necesitan hidratación, como partes de insectos, cabellos, muestras de plantas, etc.
Las muestras en seco no tienen problema de deshidratación, se pueden conservar durante años y pueden volver a observarlas en numerosas ocasiones.